故事的发生地是在一座就是漂浮在宇宙的真空里随着惯性像一颗陨石一样漫无目的地往前漂流，运气好的话，也许还有那么亿分之零点几的几率漂流到一颗可以生存的星球上去，但最大的可能还是直到这艘飞船与宇雷间的某颗星球或者陨石相撞，也不会遇到一颗可以生存的星球，或者遇到其它的飞船获救，毕竟宇宙实在是太大了，人类发展到现在，也不知道宇宙到底有没有边际。名为星元市的小城市。 在市内的狮子尾山上，耸立着一个闪耀着彩色光芒的巨大物体，这个被命名为“摩诺之角”的物体，实际上是16年前“怪兽之日”事件发生之后就矗立在那里的“怪兽的角”。 在世界各地同时出现怪兽的“怪兽之日”事件发生之后，怪兽灾害开始变得日常。日本的地球防卫队开始以武力对付怪兽的同时，怪兽防灾科学调查所（统称SKIP Scientific Kaiju Investigation and Prevention center）也为了防止怪兽灾害的发生和受灾情况扩大，不断对各地区进行科学调查和避难引导。这个组织时至今日，还在不停地调查“怪兽之日”出现的原因和城市中的“摩诺之角”。 年仅7岁的“优马”在狮子尾山与父母露营时，遭遇了怪兽袭击，他奇迹般地生还并毫发无伤。以此为契机，“优马”踏上了研究怪兽生物学的道路。虽然有着痛苦的过去...
