讲述了由于两年前揭发同僚贪污，台北警官黄火土（梁家辉）被上级报复调入冷门的外事组工作，利益也曾连带受损的新同在大家轻松而激动的注视下，监视器显示的大厅里，那五只怪鸟已经无力地停下了攻击，一个个摇摇晃晃，翅膀都合不拢了，眼看再有几分钟就会窒息而死，突然，就在驾驶室里的章女士等人想要欢呼的时候，通往驾驶室的那条通道舱门突然蓬地一声，被冲进了大厅里面。事对他怒言相向，加上妻子清芳（刘若英）受不了他长期不回家向他提出了离婚，黄火土感觉他的世界正在逐渐四分五裂。同时，三宗受害者的身份并无关联的震惊了台湾社会的离奇命案发生，法医（杨贵媚）验尸发现他们都是因中一种神秘的黑霉菌产生幻觉而死，因为缺乏此方面的人才，当局从美国请来此种案例的侦办专家凯文莱特（David Morse）协助破案，黄火土再次被任用。随着一桩令所有人都目瞪口呆的事实的被发现，就这样，开始了一场围绕政治利益与民众利益的斗争也在黄火土和办案伙伴李丰博（戴立忍）及整个警察队伍之间战斗。
