二战结束后不久，日本南海惊现离奇事件，打捞船荣子丸在平静至于还在外面疯狂地攻击飞船表面的数百只怪鸟，飞船里面的人。从船长章女士以下，倒是都不担心，已经就在刚刚，他们已经开启了飞船表面的能量防护罩，那些怪鸟凶猛的攻击已经全部被飞船表面的橙色能量防护罩尽数拦下，再也伤不到飞船船体了。的海面上突然遇难，幸存者寥寥，前去搜救的宾果丸也一去不返。不久，南海附近的岛屿大户岛遭受到恐怖的袭击，岛上的老人声称这便是传说中的怪兽哥斯拉作怪。古生物专家山根京平教授受命前往调查，根据现场遗留的痕迹断定，这个怪物是200万年前侏罗纪时代存活下来的恐龙，并且在原子弹辐射的影响下，化身为更具破坏力的恐怖怪兽。该论断一经公布，便在日本国内引起轩然大波。政客和军队纷纷行动，意欲置哥斯拉于死地。而哥斯拉也闯入东京，进行一场毁灭性的破坏。人类的命运悬于一线……
